Organy mają obecnie następującą dyspozycjęDyspozycja organów została opracowana na podstawie stron: Wirtualne Centrum organowe – Słownik terminów organowych https://web.archive.org/web/20200321105720/http://www.organy.pro/slownik.php i Gdańskie Organy – Organy Katedry w Oliwie, autor Marek Michalak https://web.archive.org/web/20200321105720/http://www.organy.pro/slownik.php https://web.archive.org/web/20120315132930/http://www.gdanskie-organy.com/organs.php?lang=pl&loc=oliwa&tab=stoplist. Wynika z nich, iż w polskiej terminologii obowiązuje terminologia niemiecka, jakkolwiek niektóre nazwy instrumentów mogą być tłumaczone na jęz. polski, jeżeli mają odpowiedniki.: I Hauptwerk C– II Schwellwerk C– III Kronwerk C– IV Hinterwerk* C– Pedalwerk C–Prinzipal 16'Oktave 8'Spielflöte 8'Oktave 4'Hohlflöte 4'Quinte 22/3′Oktave 2'Flachflöte 2'Mixtur VIZimbel IIITrompete 16'Trompete 8'Gedackt 16'Violprinzipal 8' Gemshorn 8'Schwebung 8'Rohrflöte 8' Oktave 4'Blockflöte 4'Nasat 22/3′Waldflöte2'Terz13/5′Septime 11/7′Mixtur V Englisch Horn 16'Oboe8'TremulantGedackt 8'Quintadena 8'Prinzipal 4'Rohrflöte 4'Oktave 2'Nasat 11/3′Sifflöte 1'Sesquialtera IIScharf IVKrummhorn 8'Schalmei 4'TremulantFlûte allemande* 16'Flûte harmonique* 8'Salicional* 8'Voix célèste* 8'Principal* 4'Fugara* 4'Flûte octaviante* 4'Octavin* 2'Cornett* V 8'Plein jeu* V