W latach 1917–1930 wydział medyczny był częścią Państwowego Uniwersytetu Moskiewskiego, odłączony w 1930 i przekształcony w I Moskiewski Instytut Medyczny.
W czasie wielkiej wojny ojczyźnianej (1941-1945) I Moskiewski Instytut Medyczny wykształcił 2632 lekarzy. Za wybitne osiągnięcia w rozwoju nauk medycznych i kształcenia personelu medycznego w 1940 r. instytut został odznaczony Orderem Lenina i przemianowany na Odznaczony Orderem Lenina I Moskiewski Instytut Medyczny. W 1955 roku instytut otrzymał imię Iwana Sieczenowa.
W 1990 Odznaczony Orderem Lenina I Moskiewski Instytut Medyczny im. I.M. Sieczenowa został przekształcony w Moskiewską Akademię Medyczną im I.M. Sieczenowa, od 2010 ponownie przemianowany na Pierwszy Moskiewski Państwowy Uniwersytet Medyczny im. I.M. Sieczenowa. W 2017 otrzymał nazwę skróconą Uniwersytet Sieczenowski.
Wydziały i Instytuty W skład Uniwersytetu Sieczenowskiego wchodzi 4 wydziałów oraz 10 instytutów: