Małgorzata Wojtkowiak (ur. 30 stycznia 1982 w Poznaniu) – polska florecistka, czterokrotna medalistka mistrzostw świata. Reprezentowała klub AZS-AWF Poznań.
W 1998 roku zdobyła indywidualnie brązowy medal na mistrzostwach świata kadetów w Valencii. Na rozgrywanych rok później mistrzostwach świata juniorów w Keszthely zdobyła brąz indywidualnie wśród kadetów i złoto drużynowo wśród juniorów. Następnie była trzecia indywidualnie i pierwsza drużynowo na mistrzostwach świata juniorów w South Bend. Podczas mistrzostw świata juniorów w Gdańsku w 2001 roku zwyciężyła w obu konkurencjach. Zdobyła również srebrny medal drużynowo na mistrzostwach świata juniorów w Antalyi w 2002 roku
Podczas mistrzostw świata w Lizbonie w 2002 roku Polki w składzie: Sylwia Gruchała, Małgorzata Wojtkowiak, Anna Rybicka i Magdalena Mroczkiewicz zdobyły srebrny medal w turnieju drużynowym. W tej samej konkurencji zdobyła następnie złote medale na mistrzostwach świata w Hawanie i mistrzostwach świata w Petersburgu oraz brązowy na mistrzostwach świata w Nowym Jorku.
Wystartowała na igrzyskach olimpijskich w Pekinie w 2008 roku, gdzie była siódma drużynowo, a indywidualnie zajęła 21. miejsce.