Christian Nerlinger (ur. 21 marca 1973 w Dortmundzie) – niemiecki piłkarz, występował na pozycji pomocnika.
Kariera klubowa Nerlinger jako junior grał w klubach TSV Forstenried i Bayern Monachium, do którego trafił w 1985 roku. Do pierwszej drużyny Bayernu został przesunięty przed rozpoczęciem sezonu 1993/94. W Bundeslidze zadebiutował 7 sierpnia 1993 w wygranym przez jego zespół 3-1 pojedynku z SC Freiburgiem. Natomiast pierwszego gola w zawodowej karierze strzelił 22 sierpnia 1993 w spotkaniu z Dynamem Drezno, wygranym przez Bayern 5-0. Na koniec sezonu zajął z klubem pierwsze miejsce w lidze i został mistrzem Niemiec. Na kolejny sukces czekał z Bawarczykami do 1996 roku, kiedy to triumfowali w Pucharze UEFA, a także zostali wicemistrzem Niemiec. Rok później zwyciężyli w rozgrywkach ligi niemieckiej oraz Pucharu Ligi, a w 1998 w Pucharze Niemiec. W tym samym roku zostali także wicemistrzem Niemiec. Łącznie w barwach Bayernu Nerlinger wystąpił 156 razy i zdobył 27 bramek.
W 1998 roku przeszedł do Borussii Dortmund. Pierwszy występ zanotował tam 14 sierpnia 1998 w przegranym przez Borussię 1-2 ligowym pojedynku z VfB Stuttgart. Na Westfalenstadion spędził trzy lata.