Michael Jakobsen (ur. 2 stycznia 1986 w Kopenhadze) – duński piłkarz występujący na pozycji obrońcy w australijskim klubie Adelaide United.
Kariera klubowa Michael Jakobsen zawodową karierę rozpoczął w 2002 w Boldklubben af 1893. W 2003 przeniósł się do PSV Eindhoven, w barwach którego rozegrał tylko jeden mecz w Eredivisie – 28 marca 2004 w przegranym 1:3 spotkaniu z Willem II w 84 minucie zmienił Kaspera Bøgelunda. Jakobsen postanowił zmienić klub i ostatecznie w lutym 2005 podpisał kontrakt z Aalborg BK. W nowej drużynie zadebiutował 13 marca w zremisowanym 1:1 pojedynku ligi duńskiej przeciwko Brøndby. Przez cały sezon Jakobsen rozegrał piętnaście ligowych spotkań, natomiast podczas rozgrywek 2006/2006 wystąpił w 28 meczach. W sezonie 2006/2007 duński obrońca w 32 występach zdobył sześć goli i był jednym z najlepszych strzelców w swoim zespole.