24 października 2019 r. władze łotewskie zarejestrowały Łotewski Autonomiczny Kościół Prawosławny, uznający zwierzchnictwo patriarchy Konstantynopola; Łotewski Kościół Prawosławny nie uznał tej struktury za kanoniczną.
8 września 2022 r. łotewski Sejm uchwalił ustawę, na mocy której Łotewski Kościół Prawosławny stał się niezależny od jakiejkolwiek struktury kościelnej za granicą, a zatem także od Rosyjskiego Kościoła Prawosławnego. Duchowieństwo Kościoła zaakceptowało nowe przepisy, a na soborze Kościoła 20 października 2022 r. stosowne zapisy zostały wniesione również do statutu wewnętrznego Kościoła. Sobór Kościoła zwrócił się oficjalnie do patriarchy moskiewskiego i całej Rusi o uznanie Łotewskiego Kościoła Prawosławnego za autokefaliczny. Dotychczas Rosyjski Kościół Prawosławny ani żadna z innych cerkwi lokalnych nie uznała autokefalii Łotewskiego Kościoła PrawosławnegoLatvian Orthodox Church has not sought autonomy recognition from Patriarch Bartholomew .
13 sierpnia 2023 r. w Rydze odbyła się chirotonia biskupia archimandryty Jana (Lipšānsa), którą przeprowadzono bez konsultacji z patriarchą moskiewskim i całej Rusi. Rosyjski Kościół Prawosławny stoi na stanowisku, że dopiero sobór biskupów mógłby przyjąć lub odrzucić prośbę Łotewskiego Kościoła Prawosławnego, a wspomnianej chirotonii nie uznaje.