Wielki rewanż Hornish wziął w sezonie 2006, który okazał się najbardziej wyrównanym w historii, biorąc pod uwagę także mistrzostwa CART oraz dawny cykl USAC National Championship. Amerykanin zdobył tyle samo punktów, co broniący tytułu Wheldon, ale miał na koncie więcej zwycięstw (cztery przy dwóch Anglika) i mógł świętować swój trzeci tytuł mistrzowski. Warto dodać, że partner Hornisha z zespołu, Hélio Castroneves, zdobył zaledwie dwa punkty mniej, co wystarczyło tylko do trzeciego miejsca w klasyfikacji.
Sezon 2007 okazał się bardzo nieudany dla całej ekipy Penske. Hornish, podobnie jak Castroneves, odniósł tylko jedno zwycięstwo i nie liczył się w walce o tytuł mistrzowski.
Indianapolis 500 thumb|240px|Sam Hornish Jr. podczas treningu przed Indianapolis 500 2007
Przez wiele lat w Indianapolis 500 Hornisha prześladował wybitny pech. Spośród pierwszych sześciu startów w słynnym majowym klasyku, nie ukończył aż czterech, a najlepszym wynikiem było zaledwie 14. miejsce. Dopiero w 2006 roku nastąpił przełom;