Pierwszy występ zanotował tam 5 listopada 1983 w wygranym przez Schalke 2-0 ligowym spotkaniu z Bayer Leverkusen. W ekipie z Gelsenkirchen szybko wywalczył sobie miejsce w wyjściowej jedenastce i stał się jej podstawowym graczem. Na koniec debiutanckiego sezonu uplasował się z klubem na szesnastej pozycji w lidze i po przegranych barażach z Bayerem Uerdingegn spadł z ligi. Po rocznym pobycie na zapleczu ekstraklasy, powrócił z Schalke do Bundesligi. W drużynie z Arena AufSchalke spędził pięć lat i w tym czasie zagrał tam 148 razy.
W 1988 roku przeniósł się do drugoligowej Herthy BSC. W 1990 roku awansował z tym klubem do ekstraklasy, ale rok później powrócili do 2. Bundesligi. Później był także graczem Bayeru Leverkusen i Fortuny Köln, a w 1996 roku zakończył karierę.
Po zakończeniu kariery Junghans został trenerem bramkarzy. Pracował w 1. FC Köln, Benfice Lizbona i Athleticu Bilbao. W sezonie 2006/2007 był asystentem trenera w Borussii Mönchengladbach, a od lutego 2007 roku pracuje jako trener bramkarzy w Bayernie Monachium.
Kariera reprezentacyjna W 1980 roku Junghans został powołany do kadry na Mistrzostwa Europy, które wygrali Niemcy.