Czas innowacji – lata 90. XX wieku Lata 90. dla zegarków Seiko były czasem wielu innowacji i osiągnięć. Firma zaprezentowała szereg nowych modeli, w tym zegarki do nurkowania z cyfrowym wyświetlaczem i czujnikiem głębokości, a także modele Kinetic ze stoperem, wskazaniem drugiej strefy czasowej oraz wersją z wiecznym kalendarzem. W tym okresie opracowano także zegarek Thermic z mechanizmem generującym energię elektryczną dzięki ciepłocie ciała noszącego go. Seiko wprowadziło także zegarki sterowane radiowym sygnałem czasu.
W 1992 roku został oficjalnym dostawcą pomiaru czasu Letnich Igrzysk Olimpijskich w Barcelonie.
W 1998 roku na rynek wchodzi nowa generacja zegarków analogowych, natomiast rok później premiera ma miejsce Spring Drive – zegarki z miernikiem sprawność kwarcu, a także Ultimate Kinetic Chronograph.
Czasy współczesne W 2005 roku na rynek wchodzą zegarki z kontrolerem fal radiowych, a rok później zaprezentowano E-Ink – zegarki stworzone na bazie elektronicznego tuszu. W 2010 zostaje zaprezentowany zegarek EPD z aktywnym systemem matrix, a w 2012 – z solarem GPS.