Capcom rozgrywkę w Dino Crisis określiło jako panic horror. Twórcy gry skupili się na tym by rozgrywka nie koncentrowała się tylko na akcji i strzelaniu do dinozaurów. W grze pojawia się suspens oraz wiele zagadek do rozwiązania.

Fabuła Gra rozpoczyna się w roku 2009 na fikcyjnej wyspie Ibis. Agent S.O.R.T. (Secret Operation Raid Team) Tom zostaje wysłany w celu infiltracji wyspy. Na miejscu odkrywa, że na wyspie przebywa doktor Edward Kirk i prowadzi badania nad nowym rodzajem energii, która w niepowołanych rękach, może stać się straszliwą bronią. Agencja postanawia wysłać dodatkowo czwórkę agentów (Regina, Gail, Rick oraz Cooper) aby schwytali doktora Kirka. Agenci dostają się na wyspę za pomocą spadochronów i rozpoczynają swoją misję. Agent Cooper ląduje daleko od miejsca zbiórki w samym centrum dżungli. Jego obecność szybko odkrywa Tyranozaur Rex i po krótkim pościgu pożera go. Nieświadomi zagrożenia pozostali członkowie S.O.R.T. docierają do bazy. Ich oczom ukazują się zmasakrowane zwłoki personelu oraz naukowców. Chwilę później odkrywają, że za masakrą stoją dinozaury. Niestety helikopter, którym dostali się na wyspę zostaje zniszczony przez Tyranozaura. Uwiezieni na wyspie rozpoczynają grę o przetrwanie...