Rozgrywki rosyjskiej pierwszej ligi w sezonie 1999 były ósmymi w historii rosyjskiej pierwszej ligi. Rozpoczęły się 3 kwietnia 1999 roku, zakończyły się natomiast 8 listopada 1999 roku. W rozgrywkach wzięło udział szesnaście drużyn, w tym dwie, które awansowały z Pierwszej Dywizji – Saturn Ramienskoje i Lokomotiw Niżny Nowogród. Mistrzowski tytuł po raz czwarty z rzędu wywalczyła drużyna Spartaka Moskwa. Królem strzelców ligi został Giorgi Demetradze z Ałaniji Władykaukaz, który zdobył 21 goli.
Drużyny
DrużynaMiastoStadionPojemnośćPozycja w 1998WładykaukazRepublikański Stadion Spartak32,464MoskwaŁużniki84,745NoworosyjskStadion Trud12,500MoskwaStadion Dinamo36,540SamaraStadion Mietałłurg33,220MoskwaStadion Lokomotiwu28,800Niżny NowogródStadion Lokomotiw17,765Rostów nad DonemStadion Olimp-217,000WołgogradStadion Centralny38,000RamienskojeStadion Saturn16,726MoskwaŁużniki84,745JarosławStadion Szynnik23,012MoskwaŁużniki84,745ElistaStadion Urałan15,200PetersburgStadion Pietrowski21,745SocziStadion Centralny im. Sławy Metreweli12,000
Tabela