Peter Niemeyer (ur. 22 listopada 1983 w Hörstel) – niemiecki piłkarz występujący na pozycji obrońcy lub pomocnika.
W swojej karierze grał w takich zespołach jak FC Twente, Werder Brema, Hertha BSC oraz Darmstadt 98.
Kariera klubowa Niemeyer karierę rozpoczynał w SV Teuto Riesenbeck. W latach 1996–1999 był graczem Borussii Emsdetten. W 1999 roku przeszedł do juniorskiej ekipy holenderskiego FC Twente. Tam spędził trzy lata, a w sezonie 2002/2003 został przesunięty do pierwszej drużyny Twente. W Eredivisie zadebiutował 26 kwietnia 2003 w wygranym 1-0 meczu z Excelsiorem Rotterdam. W debiutanckim sezonie w lidze zagrał trzy razy. Od początku sezonu 2003/2004 stał się podstawowym graczem Twente. 23 listopada 2003 w wygranym 4-0 pojedynku z ADO Den Haag strzelił pierwszego gola w trakcie gry w ekstraklasie. Na koniec sezonu 2005/2006 jego klub uplasował się na dziewiątej pozycji w lidze i awansował do Pucharu UEFA. Zakończył go jednak na drugiej rundzie kwalifikacyjnej, po porażce w dwumeczu z Levadią Tallinn. W Twente Niemeyer grał do stycznia 2007. W sumie rozegrał tam 106 ligowych spotkań i zdobył w nich 4 bramki.