Batalion Portowy Wojsk Ochrony Pogranicza Szczecin – zlikwidowany specjalistyczny pododdział Wojsk Ochrony Pogranicza pełniący służbę na granicy morskiej.
Formowanie i zmiany organizacyjne W lipcu 1949 sformowano w Szczecinie samodzielny batalion kontroli granicznej w Szczecinie Porcie JW 30 o etacie nr 94/1 i 5 strażnic liniowych w strukturach 8 Brygady Ochrony PograniczaRozkaz MBP nr 055/0rg. z 7.06.1949..
W 1950 batalionowi został nadany numer JW 3064 i został on przeformowany w batalion portowy WOP w Szczecinie o etacie 094/6Rozkaz MBP nr 043/0rg. z 3.06.1950.. W następnych latach ulegał kolejnym zmianom organizacyjnym.
W latach 50. XX w. przeniesiono sztab batalionu portowego z ulicy Kapitańskiej 5 do koszar sztabu brygady przy ulicy Żołnierskiej 4.
W marcu 1953 rozformowano istniejące kompanie i powołano na ich miejsce strażnice.
Na podstawie decyzji MSW z 24 maja 1989, zaakceptowano zmiany w organizacji jednostek WOP ujęte w planie restrukturyzacji. Jednocześnie dowódca WOP otrzymał polecenie rozformowania batalionów portowych WOP do 30 czerwca 1990Zarządzenie DWOP nr 028 z 25.04.1990..