Medycyna Praktyczna, 2014. spadek masy ciała ból brzucha wzdęcie ataksja neuropatia obwodowa obrzęki będące wynikiem enteropatii z utratą białek objawy niedoboru witaminy D – osteomalacja, osteoporoza, krzywica (u dzieci), tężyczka objawy niedoboru witaminy A – ślepota zmierzchowa, zaburzenia dotyczące naskórka objawy związane z zaburzeniami układu immunologicznego związanymi z przedostawaniem się zwiększonej ilości antygenów bakteryjnych z jelita do krwi – rumień guzowaty, osutka, zapalenie stawów (np. zapalenie stawów wywołane jelitowym zespoleniem omijającym u chorych z zespołem ślepej pętli wywołanym wytworzeniem zespolenia jelitowo-jelitowego).
U wielu osób z zespołem rozrostu bakteryjnego nie stwierdza się żadnych objawów chorobowych
Badania dodatkowe thumb|Pobranie materiału z jelita czczego i wykonanie jego posiewu uważane jest za podstawową procedurę diagnostyczną zespołu rozrostu bakteryjnego. Stwierdzenie ponad 105 CFU w 1 ml pożywki potwierdza rozpoznanie. W badaniach laboratoryjnych krwi stwierdza się niedokrwistość makrocytarną, hipoalbuminemię oraz inne niespecyficzne zaburzenia zależne od uszkodzenia poszczególnych narządów. Badanie rentgenowskie przewodu pokarmowego może ujawnić wady anatomiczne w jego zakresie, a więc uchyłki, „ślepą pętlę”, zwężenia jelit, przetoki.