Komendanci (1922–1949) 1922–1929: gen. bryg. dr med. Stefan Bolesław Józef Hubicki 1925–1925: gen. bryg. dr med. Bronisław Jakesch 1925–1926: gen. bryg. dr med. Franciszek Zwierzchowski 1929–1931: gen. bryg. dr med. Zygmunt Gilewicz 1931–1933: płk dr med. Władysław Leon Osmolski 1933–1939: płk dr med. Ksawery Maszadro 1941–1943: płk prof. dr med. Antoni Jurasz 1943–1945: mjr prof. dr med. Tadeusz Rogalski 1945–1949: mjr prof. dr med. Jakub Rostowski
Komendanci-rektorzy (1958–2003) 1958–1965: gen. bryg. prof. dr hab. med. Marian Garlicki 1965–1972: kontradm. prof. dr hab. med. Wiesław Łasiński 1972–1975: płk doc. dr hab. med. Józef Barancewicz 1975–1978: gen. bryg. prof. dr hab. med. Jerzy Bończak 1978–1981: płk prof. dr hab. med. Tadeusz Brzeziński 1981–1991: gen. bryg. prof. dr hab. med. Władysław Tkaczewski 1991–1998: gen. bryg. prof. dr hab. med. Henryk Chmielewski 1998–2002: płk prof. dr hab. med. Jan Chojnacki 2002–2003: płk prof. dr hab. med.