Do jego jednostek należą:
Jednostki Międzywydziałowe Archiwum UMK – Oddział Zamiejscowy w Bydgoszczy Biblioteka Medyczna Centrum Badań Naukowych Chorób Klatki Piersiowej Centrum Języków Specjalistycznych w Medycynie Centrum Kształcenia w Języku Angielskim Collegium Medicum UMK Centrum Przedsiębiorczości Akademickiej i Transferu Technologii (CPATT) Centrum Symulacji Medycznych Collegium Medicum UMK Centrum Komunikacji Klinicznej Studium Wychowania Fizycznego i Sportu CM Samodzielne Stanowisko ds. Doświadczeń na Zwierzętach Komisja Bioetyczna
Przy Wydziale Farmaceutycznym na terenie kampusu SU nr 1 im. dr. A. Jurasza prowadzony jest Ogród Roślin Leczniczych i Kosmetycznych.
Kierunki studiów Jednostka daje możliwość podjęcia studiów I i II stopnia oraz jednolitych magisterskich na siedemnastu kierunkach prowadzonych w ramach trzech wydziałów, z polskim oraz angielskim językiem wykładowym:
Wydział Lekarski biotechnologia medyczna (I i II stopnia) kierunek lekarski (jednolite magisterskie) medicine kierunek lekarsko-dentystyczny (jednolite magisterskie) optyka okularowa z elementami optometrii (I stopnia) optometria (II stopnia)
Wydział Farmaceutyczny analityka medyczna (jednolite magisterskie) farmacja (jednolite magisterskie) pharmacy kosmetologia (I i II stopnia)