Przyroda Flora thumb|Tabliczka pamiątkowa na jednym z kasztanowców Na terenie Cytadeli zinwentaryzowano 170 taksonów roślin drzewiastych. Najstarszych z nich (ponad 100-letnich) jest niewiele. W fazie początkowej nie było większych nasadzeń z powodów militarnych. Ogromna liczba drzew ucierpiała w 1945 i została bezpowrotnie stracona. Z tych, które dotrwały do czasów obecnych, należy wymienić takie gatunki, jak klon zwyczajny, grusza pospolita, kasztanowiec zwyczajny, wiąz szypułkowy, dąb szypułkowy, jesion wyniosły, klon jawor i robinia akacjowa. Większość roślin ozdobnych wprowadzono dopiero w latach 60. XX wieku, podczas urządzania założeń parkowychBeata Borowiak-Sobkowiak, Barbara Wilkaniec, Agnieszka Wilkaniec, Hanna Piekarska-Boniecka, Paweł Trzciński, Stopień zasiedlenia dendroflory Parku Cytadela w Poznaniu przez mszyce, w: Postępy w Ochronie Roślin, 49(1)/2009, s.91.