Koeman chcąc wzmocnić drużynę, ponieważ ta grała w europejskich pucharach zdecydował się kupić nowych bocznych obrońców – Cedrica Soaresa oraz Cuco Martinę. Do klubu dołączyli także pomocnicy (Oriol Romeu i Jordy Clasie), oraz napastnik Juanmi. Wskutek kontuzji pierwszego bramkarza drużyny wypożyczono Maartena Stekelenburga i obrońcę Stevena Caulkera. Kontrakt z klubem podpisał także Virgil van Dijk. 27 sierpnia 2015 roku Southampton odpadł z rozgrywek Ligi Europy, przegrywając dwumecz z FC Midtjylland. Święci dość szybko odpadli z krajowych pucharów przegrywając w trzeciej rundzie FA Cup, oraz piątej rundzie Pucharu Ligi Angielskiej. W styczniu zespół wzmocnił napastnik Charlie Austin. W drugiej części sezonu drużyna prezentowała bardzo wysoką formę, co przełożyło się na wysokie 6. miejsce ligowe (kolejny awans w ligowej tabeli) i ostateczny awans do fazy grupowej rozgrywek Ligi Europejskiej. 13 czerwca 2016 roku Ronald Koeman opuścił Southampton i podpisał kontrakt z Evertonem.
mały|Wyjściowe ustawienia Southampton i Manchesteru United w finałowym spotkaniu Pucharu Ligi Angielskiej w 2017 roku.