Po zakończeniu II wojny światowej kościół pismem Starosty Powiatu Bydgoskiego z dnia 17 lutego 1945 r. został przekazany parafii pw. św. Stanisława Biskupa i Męczennika w Solcu Kujawskim. 9 września 1945 r. świątynia została poświęcona przez ks. Franciszka Hanelta i służyła w latach 1945-1958 jako kościół filialny parafii w Solcu Kujawskim. W tym czasie wnętrze przystosowano do pełnienia liturgii katolickiej.
1 lipca 1958 r. został utworzony w Łęgnowie-Plątnowie ośrodek duszpasterski. Odtąd świątynia służyła miejscowym wiernym. Parafia pw. Matki Bożej Królowej Polski została erygowana oficjalnie 31 maja 1968 r. przez kard. Stefana Wyszyńskiego.
W latach 1972–1974 w miejsce rozebranej pastorówki wybudowano plebanię, a budynek gospodarczy przerobiono na dom katechetyczny. Obecnie mieści się w nim magazyn Caritas diecezji bydgoskiej.
W 1978 r. tereny Łęgnowa wraz z kościołem zostały włączone w obręb administracyjny miasta Bydgoszczy.
Architektura Kościół zbudowany został w stylu neogotyku, popularnie stosowanym w Bydgoszczy w architekturze sakralnej na początku XX w.Parucka Krystyna. Zabytki Bydgoszczy – minikatalog. „Tifen” Krystyna Parucka.