Z powodzeniem ubiegał się o poselską reelekcję w wyborach w 2005, 2009, 2013, 2014, 2017, kwietniu, lipcu i listopadzie 2021, 2022 i 2023.
W sierpniu 2005 uzyskał nominację na ministra ochrony środowiska i zasobów wodnych w rządzie Sergeja Staniszewa. Urząd ten sprawował do lipca 2009. W lutym 2024 został powołany na współprzewodniczącego DPS (obok Delana Peewskiego).
W wyborach w czerwcu 2024 uzyskał mandat posła 50. kadencji oraz mandat deputowanego do Parlamentu Europejskiego, decydując się przyjąć pierwszy z nich i pozostać w krajowym parlamencie. Wkrótce po tych wyborach w DPS doszło do wewnętrznego konfliktu między frakcją Delana Peewskiego a grupą wspierającą honorowego przewodniczącego Achmeda Dogana, do której zaliczał się również Dżewdet Czakyrow. W klubie poselskim przewagę utrzymała pierwsza z nich, wykluczając ze swoich szeregów przedstawicieli drugiej frakcji. Do kolejnych wyborów krajowych z października 2024 frakcja ta przystąpiła ostatecznie pod szyldem APS (konkurując z kierowanym przez Delana Peewskiego komitetem DPS-NN, którego Ruch na rzecz Praw i Wolności stał się formalnym uczestnikiem). Dżewdet Czakyrow z ramienia APS uzyskał wówczas poselską reelekcję. W trakcie kadencji opuścił to ugrupowanie, a później ponownie związał się z kierowanym przez Delana Peewskiego DPS.