Samica posiada 3 pary sutek.
Tryb życia Prowadzi samotniczy i głównie nocny tryb życia. Poszczególne areały osobnicze nakładają się na siebie i wynoszą 9,7-16,4 ha. W dzień odpoczywają w skalistych jamach, do których nie powracają w ciągu dnia. Porozumiewają się głównie poprzez gesty ciała.
Okres godowy i rozrodczy trwa prawdopodobnie w lutym i marcu. Po ciąży trwającej 9 tygodni samica rodzi 3-7 młodych (najczęściej 5). Młode odstawiane są od mleka, kiedy zaczną przyjmować regularny pokarm. Dojrzałość płciową uzyskują prawdopodobnie między 10 a 11 miesiącem życia.
Skunksowiec patagoński odżywia się głównie owadami, które latem mogą stanowić 81,6% jego diety. W okresie jesienno-zimowym pokarm uzupełnia małymi ssakami, padliną i owocami.
Podgatunki Wyróżnia się 3 podgatunki: C. humboldtii castaneus C. humboldtii humboldtii C. humboldtii proteus
Znaczenie Skunksowiec patagoński ma niewielu wrogów. Polują na niego najprawdopodobniej niektóre patki drapieżne lub sowy.
Zagrożenie i ochrona W Czerwonej księdze gatunków zagrożonych