mały|300x300px|Model farmakoforu miejsca wiązania benzodiazepin na receptorze GABAA mały|469x469px|Mewastatyna w centrum katalitycznym reduktazy HMG-CoA mały|318x318px|Molekularne mechanizmy działania farmaceutyków. Leki stają się efektywne m.in. dzięki wpływaniu na transdukcję sygnałów, metabolizm i potencjał czynnościowy Chemia leków także chemia medyczna lub chemia farmaceutyczna – dyscyplina badawcza znajdującą się na pograniczu chemii i farmakologii. Głównym celem chemii medycznej jest projektowanie, synteza i badanie właściwości indywiduów chemicznych użytecznych w terapii, a także dopracowanie metod otrzymywania tych substancji w celu obniżenia kosztów produkcji. Cele te wiążą się też z badaniem już istniejących leków, zwłaszcza na poziomie ich oddziaływania z cząsteczką docelową. Jedną z głównych metod badawczych rozwiniętych w tym celu jest QSAR (ilościowa zależność pomiędzy strukturą a reaktywnością).
W Polsce dyscyplina ta stanowi przedmiot obowiązujący na studiach farmaceutycznych i jedną z podstawowych dyscyplin zawodowych farmaceutów.