Zgromadzonych w kościele uchodźców pognano na Wolę, a stamtąd do obozu w Pruszkowie. W trakcie marszu, m.in. nieopodal Galerii Luxenburga, niemiecka eskorta zamordowała co najmniej 10 osób. Jedną z ofiar był ksiądz Trzeciak, zastrzelony przez szeregowego żołnierza. Później na terenie kościoła miały miejsce co najmniej trzy zbiorowe egzekucje, w których Niemcy zamordowali około 110 osób (8-10 sierpnia). Z kolei „ewakuacja” Szpitala Maltańskiego została ostatecznie przeprowadzona w dniu 14 sierpnia. W dwóch egzekucjach dirlewangerowcy zamordowali tam łącznie ok. 30 osób (7 i 14 sierpnia).
10 sierpnia Niemcy spędzili od 100 do 300 polskich mężczyzn i chłopców na podwórze Hotelu de Saxe przy ul. KoziejByli to w większości mieszkańcy domów przy ul. Koziej 3 i 5 oraz przy ul. Focha 1, 6, 8 i 10. Patrz: .. Byli oni następnie wprowadzani dziesiątkami do budynku i rozstrzeliwani w sieniach bądź na jego wyższych kondygnacjach. Po zakończeniu egzekucji żołnierze dobili dające oznaki życia ofiary, po czym podpalili hotel. Po wojnie udało się ustalić nazwiska 40 zamordowanych.