Bongani Sandile Khumalo (ur. 6 stycznia 1987 w Manzini w Suazi) – południowoafrykański piłkarz grający na pozycji środkowego obrońcy.
Kariera klubowa Khumalo urodził się w Suazi, ale w wieku 2 lat wyemigrował z rodzicami do Republiki Południowej Afryki. Tam też rozpoczął karierę piłkarską w klubie Arcadia Shepherds. W 2005 roku został zawodnikiem drużyny University of Pretoria FC i przez dwa lata występował w podstawowym składzie w rozgrywkach Mvela League (II liga RPA). W 2007 roku przeszedł do Supersport United z Pretorii i zadebiutował w jego barwach w Premier Soccer League (I liga). Tam, podobnie jak w poprzednim klubie, stał się podstawowym zawodnikiem. W 2008 roku wywalczył z Supersport mistrzostwo Republiki Południowej Afryki. W 2009 roku obronił z tym klubem tytuł mistrzowski. Podczas zimowego okienka sezonu 2010/2011 dołączył do londyńskiego klubu Tottenham Hotspur za 1,8 miliona euro podpisując kontrakt do 2015 r. W marcu dołączył do Preston North End na zasadzie wypożyczenia. Następnie był wypożyczany do Reading (2011-2012), PAOK FC (2012-2013), Doncaster Rovers (2013-2014) i Colchester United (2014-2015). Jesienią 2015 grał w Supersport United FC.