NrNazwaLata istnieniaPołożenie 1. Kościół św. Idziego Ok. 1238-1879 Przedmieście Kujawskie 2. Kościół Mariacki Karmelitów 1398 (1550)-1822 Przedmieście Gdańskie, przy Bramie Gdańskiej 3. Kościół Świętej Trójcy 1550-1829 Przedmieście Poznańskie 4. Kościół św. Krzyża 1550–1834 Przedmieście Poznańskie, (za Bramą Poznańską) 5. Kościół św. Stanisława 1583-1817 Przedmieście Kujawskie, (za Bramą Kujawską) 6. Domek loretański 1682-1838 Przedmieście Kujawskie, (przed kościołem bernardynów)
Dwa kościoły zakonne władze przeznaczyły na cele świeckie, z czego kościół pobernardyński w 1838 r. przekształcono w świątynię garnizonową, zaś kościół pojezuicki przyznano katolikom niemieckim.