Do startu w II rundzie kwalifikacyjnej uprawnionych jest 80 drużyn (w tym 26 zwycięzców I rundy), z czego 40 jest rozstawionych. Losowanie odbyło się 21 czerwca 2010 w Nyonie (godz. 13:00). Ponieważ pary I i II rundy kwalifikacyjnej losowane były tego samego dnia, przyjęto założenie, że wszystkie rozstawione drużyny z I rundy wygrają swoje mecze, jeśli zaś nie – zwycięska drużyna nierozstawiona przejmuje współczynnik pokonanego. Pierwsze mecze rozegrane zostaną 15 lipca, rewanże – 22 lipca 2010.
drużyny, które awansowały z I rundy kwalifikacyjnej
Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. Drużyna Wsp. Olympiakos SFP 54,979 Bene Jehuda Tel Awiw 5,275 Beşiktaş JK 33,890 Stabæk 4,980 Dinamo Bukareszt 28,898 FK Ventspils 4,649 Lewski Sofia 25,400 Molde FK 4,480 Austria Wiedeń 16,915 Maccabi Tel Awiw 3,775 Anorthosis Famagusta 13,099 Dukla Bańska Bystrzyca 3,166 Brøndby IF 12,970 Győri ETO 3,166 Rapid Wiedeń 11,915 Rabotniczki Skopje 3,066 APOEL Nikozja 11,599 FC Honka 2,899 Wisła Kraków 8,508 Myllykosken Pallo-47 2,899 Karpaty Lwów 7,910 NK Maribor 2,891 CS Marítimo 7,659 Gefle IF 2,838 Baník Ostrawa 7,395 Dynama Mińsk 2,808 IF Elfsborg 7,338 OFK Beograd 2,800 Utrecht 7,309 Spartak Zlatibor Voda 2,800 Randers FC 6,470 Zrinjski Mostar 2,749 Motherwell 6,158 FK Bakı 2,599 Kalmar FF 5,838 Qarabağ FK 2,599 FC Lausanne-Sport 5,675 Ruch