Obecna cerkiew Wobec szybkiego wzrostu liczby emigrantów z Rosji żyjących na stałe w Buenos Aires, w 1891 proboszcz parafii Świętej Trójcy Konstantin Izrazcow postanowił podjąć działania na rzecz wzniesienia wolnostojącej cerkwi. Trzy lata później parafia pozyskała na ten cel działkę budowlaną. Planowane prace zostały wsparte przez carską rodzinę: Mikołaj II osobiście przekazał 500 rubli, wśród innych ofiarodawców była jego matka Maria Fiodorowna oraz późniejszy święty prawosławny Jan Kronsztadzki.
W 1898 został położony kamień węgielny pod przyszłą świątynię. W uroczystości wzięli udział przedstawiciele dyplomacji rosyjskiej oraz argentyńskiej. Projekt budynku wykonał architekt Alejandro Christophersen. W 1901, w obecności prezydenta Argentyny gotowa cerkiew została poświęcona. W kolejnych latach parafia Świętej Trójcy rozwijała działalność kulturalną i charytatywną, organizując przy świątyni czytelnię, chór i punkt wsparcia dla ubogich. Początkowo wśród parafian byli nie tylko Rosjanie, ale i Grecy;