Kariera trenerska Po zakończeniu kariery Möhlmann został asystentem trenera w Hamburgerze SV. tę funkcję pełnił przez rok. W 1992 roku objął stanowisko trenera Hamburgera SV. Pierwszy mecz pod jego wodzą HSV rozegrał 26 września 1992 z SG Wattenscheid 09 (2:2). W HSV Möhlmann pracował przez trzy lata. W tym czasie najwyższą pozycją zajętą z klubem była 11. w sezonie 1992/1993.
W listopadzie 1995 podpisał kontrakt z Eintrachtem Brunszwik, grającym w Regionallidze Nord (III liga). W sezonach 1995/1996 oraz 1996/1997 prowadzony przez Möhlmanna klub zajął 2. miejsce w lidze. W październiku 1997 został trenerem drugoligowego SpVgg Greuther Fürth. Pracował tam przez trzy lata, a w tym czasie najlepszym miejscem wywalczonym z klubem była 7. w sezonie 1999/2000.
W październiku 2000 przeszedł do Arminii Bielefeld, również grającej w 2. Bundeslidze. W sezonie 2000/2001 awansował z nią do Bundesligi, ale w następnym sezonie powrócił został zdegradowany do 2. Bundesligi. W lutym 2004 odszedł z Arminii do SpVgg Greuther Fürth. Tym razem trenował do końca sezonu 2006/2007.