Bitwa Gracz wybiera jednostkę i wydaje jej rozkazy, typu "ruch", "atak", lub użycie wspomnianych Spirit Commands. Niektóre jednostki są w stanie się transformować: na przykład Zeta Gundam może przemienić się w statek powietrzny, a Getter Robo może zamienić się w jedną z trzech dostępnych form, by dostosować się do walki w powietrzu, na lądzie lub pod wodą. Dodatkowo, teren na którym toczy się bitwa może mieć wpływ nie tylko na poruszanie się mechów, ale też na skuteczność poszczególnych broni: dla przykładu, zdecydowana większość broni laserowych jest bardzo słaba pod wodą a techniki wymagające atmosfery (np. Rust Hurricane Mazingera Z) nie mogą być użyte w kosmosie.

W kolejnych częściach pojawiają się misje podzielone na kilka części, które wymagają większego zaangażowania taktycznego (należy mądrze korzystać z dostępnych przedmiotów i Spirit Commands). Dodatkowo, dochodzą też "wsparcia" przy ataku jednej jednostki, lub gdy jedna jednostka chroni inna przed atakiem.