Został podzielony na okręgi Kraków, Olkusz i Żarnowiec.
Po reformie w 1803, nowy cyrkuł krakowski był jednym z 6 cyrkułów Nowej Galicji, podległych Gubernium Galicji we Lwowie.
14 października 1809, na mocy pokoju w Schönbrunnie, wraz z większością Nowej Galicji włączony do Księstwa Warszawskiego i wkrótce zlikwidowany na mocy dekretu królewskiego z dnia 17 kwietnia 1810DzP KW Nr 16, s. 143, w wykonaniu wcześniejszego dekretu z 24 lutego 1810DzP KW Nr 16, s. 128 dotyczącego rozciągnięcia Konstytucji i administracji Księstwa Warszawskiego na tereny dawnej Nowej Galicji przyłączonej do Księstwa Warszawskiego. Wszedł w skład departamentu krakowskiego.
Druga odsłona (1846–1850 i 1854–1865)
Po upadku Księstwa Warszawskiego, obszar ten utworzył 18 października 1815 państwo Wolne Miasto Kraków, które było republiką konstytucyjną opartą na Kodeksie Napoleona i własnej konstytucji. W wyniku powstania krakowskiego, które ostatecznie położyło kres istnieniu tego państwa, tereny te zostały 16 listopada 1846 po raz drugi anektowane przez Austrię i wcielone w struktury Galicji jako cyrkuł krakowski (tym razem nie obejmujący już prawobrzeżnych terenów nadwiślańskich).