Od 1992 powrócono do podziału ligi na grupy. Jednak w związku z dużą liczbą nierozegranych spotkań i licznymi uchybieniami sezon 1992 uznano za nieoficjalny, a Polski Związek Rugby wyznaczył drużynę, która zagrała w barażu o awans do I ligi. Od 1993 do 1997 dwie najlepsze drużyny drugiego poziomu rozgrywek (nazywanego wówczas serią B) otrzymywały prawo udziału w drugiej fazie rozgrywek serii A, rywalizując w grupie z dwiema najsłabszymi zespołami z pierwszej fazy rozgrywek tego poziomu – w pozostałej części sezonu reszta drużyn serii B grała o Puchar PZR. Od 1994 zrezygnowano z podziału na grupy, w 1997 do niego powrócono, w sezonie 1998/1999 ponownie go porzucono, a od sezonu 2003/2004 kolejny raz wprowadzono (w pierwszej fazie rozgrywek, w drugiej stawkę dzielono zestawiając w osobnych grupach najlepsze i najsłabsze zespoły obu grup z pierwszej fazy). Od sezonu 2005/2006 wprowadzono rundę play-off między najlepszymi zespołami obu grup i rozgrywanie finału ligi. Z podziału na grupy i fazy play-off zrezygnowano od sezonu 2007/2008.