W 1979 został członkiem Sekretariatu, a w następnym roku sekretarzem NK ZSL, wracając tym samym do Warszawy. Od VIII do IX Kongresu ZSL (1980–1984) był członkiem Prezydium i Sekretariatu NK ZSL. Był posłem w latach 1976–1985. Działał też we Froncie Jedności Narodu. W 1982 został wiceprzewodniczącym Rady Krajowej PRON oraz przewodniczącym Komisji Wsi i Rolnictwa. Od 1986 był członkiem Ogólnopolskiego Komitetu Grunwaldzkiego. W 1982 wszedł w skład Społecznego Komitetu Budowy Pomnika Wincentego Witosa w Warszawie, który został odsłonięty w 1985J. Sałkowski, T. Iwanowska, Na odsłonięcie pomnika Wincentego Witosa – a Polska winna trwać wiecznie, Warszawa 1985, str. 21.
Był żonaty z Alicją. Miał dwoje dzieci – Mariusza i Małgorzatę.
Odznaczony został Srebrnym Krzyżem Zasługi, Krzyżem Kawalerskim i Komandorskim Orderu Odrodzenia Polski, Orderem Sztandaru Pracy II klasy oraz wieloma innymi odznaczeniami i odznakami.
Został pochowany 28 października 1988 na Cmentarzu Wojskowym przy ul. Powązkowskiej w Warszawie w Alei Zasłużonych (kwatera C31-tuje-7).
W 2005 przyjaciele Jerzego Grzybczaka napisali i wydali książkę Z otwartym sercem.