Wyjątek w tym zakresie stanowi istnienie dwóch chorągwi na terenie województwa mazowieckiego: Chorągwi Stołecznej z siedzibą w Warszawie i Chorągwi Mazowieckiej z siedzibą w Płocku.
W większości przypadków przyjęte nazwy chorągwi odpowiadają nazwom nowych województw, z wyjątkiem czterech choragwi, których nazwy pochodzą od stolicy województwa. Dotyczy to: Chorągwi Białostockiej, która działa na terenie województwa podlaskiego, Chorągwi Gdańskiej, która działa na terenie województwa pomorskiego, Chorągwi Kieleckiej, która działa na terenie województwa świętokrzyskiego, Chorągwi Krakowskiej, która działa na terenie województwa małopolskiego. Chorągiew działająca na terenie województwa lubuskiego w swojej nazwie odnosi się natomiast do krainy historycznej – ziemi lubuskiej.
Związek Harcerstwa Rzeczypospolitej W ZHR chorągiew jest jednostką nadrzędną w stosunku do hufca, podlega Naczelnikowi w Organizacji Harcerzy, a Naczelniczce w Organizacji Harcerek. Pracami chorągwi kieruje komendant lub komendantka chorągwi.
Chorągwie harcerzy Chorągiew harcerzy – jednostka organizacyjną której podlegają wszystkie męskie jednostki działające na terenie danego okręgu, obejmuje przynajmniej 3 hufce.