Do najpopularniejszych koncertów należą koncerty organowe oraz coniedzielne koncerty poranne.
W 2000 w okno narteksu wstawiono nowoczesny witraż autorstwa estońskiego artysty Raita Präätsa, którego dzieła można ponadto podziwiać w Bibliotece Narodowej i centrum Konferencyjnym Sakala.
Architektura Kościół św. Mikołaja jest trójnawową, pięcioprzęsłową bazyliką z prezbiterium zakończonym poligonalnym obejściem. Wieża kościelna jest zbudowana na planie kwadratu i zwieńczona smukłym, barokowym hełmem ze ślepymi lukarnami i piętrową latarnią. Wznosi się ona na wysokość 105 metrów.
Wystrój wnętrza Ołtarz główny thumb|Ołtarz główny Ołtarz główny w kościele św. Mikołaja został wykonany w latach 1478–1481 w warsztacie lubeckiego mistrza Hermena Rode. Malowidła części zewnętrznej przedstawiają żywot patrona świątyni, św. Mikołaja natomiast część wewnętrzna wypełniona jest 30 drewnianymi rzeźbami świętych.
Z ołtarzy bocznych wymienić warto: ołtarz św. Rodziny, pochodzący z warsztatu Jana Bormana z Brukseli (ok. 1490), ołtarz Najświętszej Maryi Panny (1500), ołtarz Męki Pańskiej (pocz. XVI w.), dzieło mistrza Adriaena Isenbrandta z Brugii, wykonany na zlecenie wpływowego Bractwa Czarnogłowych, ukończony przez miejscowego artystę Michaela Sittowa.