Do głównych białek związanych z tymi procesami należy wymienić kanały jonowe, zależne od ATP pompy jonowe oraz białka wiążące jony (np. ferrytyna). Ponadto w procesach transportu lub wiązania jonów biorą udział związki małocząsteczkowe, do których zalicza się m.in. syderofory oraz jonofory. W biologii systemów wprowadzono termin metalom na opisanie wszystkich układów zaangażowanych w kontrolę stężenia jonów metali w organizmie.
Hydrolazy Hydrolazy są enzymami tworzącymi lub zrywającymi wiązania w reakcjach chemicznych, w których bierze udział cząsteczka wody. Hydrolazy tworzą jedną z sześciu podstawowych klas enzymów i biorą udział w różnorodnych procesach metabolicznych.
Do hydrolaz wykorzystujących w roli katalitycznej kationy metali należą m.in.: proteinazy zależne od jonów cynku fosfatazy zależne od jonów żelaza, manganu, magnezu i cynku anhydraza węglanowa, która wymaga obecności jonów cynku
Transport elektronów przez metaloproteiny Białka zdolne do przeprowadzania procesów związanych z transportem elektronów zalicza się do trzech głównych klas: białek zawierających centra żelazowo-siarkowe takich jak ferrodoksyna i rubredoksyna niebieskich białek zawierających miedź, do których należy plastocyjanina cytochromów