Eli Lilly (ur. 8 lipca 1838 w Baltimore, zm. 6 czerwca 1898 w Indianapolis) – amerykański żołnierz, chemik, farmaceuta, przemysłowiec, przedsiębiorca oraz założyciel firmy farmaceutycznej Eli Lilly and Company.
Życiorys Podczas wojny secesyjnej Lilly wstąpił do Armii Unii – zwerbował oddział, współtworząc baterię artylerii. W późniejszym okresie otrzymał stopień pułkownika i dowództwo jednostki kawalerii. Schwytany niedługo przed zakończeniem działań wojennych, do końca walk był przetrzymywany jako jeniec Konfederatów.
Eli Lilly and Company Po wojnie rozpoczął prowadzenie plantacji w Mississippi, jednak brak powodzenia zmusił go po śmierci żony do ogłoszenia bankructwa i powrót do wykonywania zawodu farmaceuty. Niebawem ożenił się ponownie. Razem z różnymi partnerami kierował kilkoma aptekami, zanim rozpoczął własną działalność w 1876, z zamiarem wytwarzania lekarstw i ich hurtowej dystrybucji. Firma odniosła sukces i niedługo, dzięki licznym usprawnieniom technologicznym w procesie wytwarzania leków, Lilly doszedł do znacznego majątku. Dwie istotne z wprowadzonych przez niego ulepszeń to stworzenie kapsułek żelatynowych i nadanie aromatów owocowych lekom w postaci płynnej.