Był dyrektorem Departamentu Społeczeństwa Informacyjnego w MSWiA. Od lipca 2004 do października 2005 zajmował stanowisko podsekretarza stanu w Ministerstwie Nauki i Informatyzacji. 21 grudnia 2004 w imieniu Polski zażądał zdjęcia projektu tzw. dyrektywy patentowej z porządku obrad Rady Unii Europejskiej, poświęconych rybołówstwu, co w konsekwencji spowodowało głosowanie w Parlamencie Europejskim i odrzucenie projektuPatenty: dyrektywa została odrzucona, Computerworld. W podziękowaniu za ten czyn, międzynarodowa społeczność internautów zapoczątkowała inicjatywę pod nazwą Thank you, Poland!Thank you, Poland!, zaś Włodzimierz Marciński podczas uroczystości w polskim Sejmie otrzymał podpisane podziękowania od tysięcy osób z Europy i świata zebrane w czasie inicjatywy"Thank Poland" Ceremony in Warsaw Parliament, ffii.org.
24 stycznia 2012 został pełnomocnikiem ministra administracji i cyfryzacji ds. rozwoju kompetencji cyfrowych w administracji; 26 czerwca 2012 został mianowany tzw. liderem cyfryzacji.
Od czerwca 2017 pełni funkcję prezesa Polskiego Towarzystwa Informatycznego.
Odznaczenia i wyróżnienia