Są one porozcinane dyslokacjami na niezależne bloki.
Skały dewonu i karbonu południowo-wschodniej części aulakogenu zostały sfałdowane, i stanowią podłoże paleozoicznej platformy scytyjskiej.
Geomorfologicznie obszar zapadliska dnieprowsko-donieckiego zajmują Nizina Naddnieprzańska i część Niziny Poleskiej.
Na północy Zapadlisko oddzielone jest od anteklizy woroneskiej uskokiem baranowicko-astrachańskim, na południu od tarczy ukraińskiej – uskokiem prypecko-manyckim. Granicą północno-zachodnią jest wyniesienie czernihowskie, oddzielające zapadlisko dnieprowsko-donieckie od zapadliska prypeckiego, a południowo-wschodnią - strefa fałdowa Donbasu.
Depresję Dniepr-Donieck można uznać za obiecujący obszar z zasobami geotermalnymi. Analiza techniczno-ekonomiczna wykazała, że na podstawie odwiertów naftowych i gazowych DDZ można budować elektrownie geotermalne o głębokości wiercenia lub otwierania odwiertów do 3 - 4,5 km. Na takich głębokościach 90% potencjału cieplnego wód geotermalnych w produktywnych poziomach ropy i gazu w złożach węgla nie przekracza 108 ° C.