W latach 2009–2011 był dyrektorem naukowym Instytutu Problemów Jądrowych im. Andrzeja Sołtana. Od września 2008 roku do maja 2011 roku zasiadał w Radzie Nadzorczej KGHM Ecoren. W 2011 roku rozpoczął pracę w nowo powstałym Narodowym Centrum Badań JądrowychNarodowe Centrum Badań Jądrowych.. Uczestniczył w badaniach w CERNDoniesienia prasowe, „Za małe energie”..Doniesienia prasowe, Awaria transformatora.. Członek Komisji Nazewnictwa Fizycznego przy Polskim Towarzystwie Fizycznym Komisje Zarządu Głównego PTF: Nazewnictwa Fizycznego, ptf.org.pl [dostęp 2021-09-17]..
Zajmował się m.in. wykorzystaniem struktur konforemnych w fizyce – m.in. pracował nad konforemną odmianą modelu standardowego cząstek elementarnych Konforemny Model Standardowy, Narodowe Centrum Badań Jądrowych, ncbj.gov.pl, 13 listopada 2018 [dostęp 2021-09-17]. Krzysztof Meissner, Conformal Standard Model (ang.), kanał Centrum Kopernika Badań Interdyscyplinarnych na YouTube, 20 kwietnia 2015 [dostęp 2021-09-17].. Współpracował też z noblistą Rogerem Penrose’em nad jego konforemną kosmologią cykliczną (ang. CCC) Ludwika Tomala, Prof. Meissner: Penrose to człowiek myślący w sposób prostopadły do tego, co się narzuca, Polska Agencja Prasowa, naukawpolsce.pap.pl, 7 października 2020 [dostęp 2021-09-17].