W 2001 jednostki operacyjne okręgu podporządkowano Dowództwu Wojsk Lądowych. Podstawowym zadaniem okręgu od tego momentu była obrona terytorialna oraz zabezpieczenie logistyczne jednostek stacjonujących na jego terytorium.
Zadania Okręgu POW przede wszystkim zabezpieczał logistycznie działanie związków taktycznych stacjonujących na jego terenie. Prowadził działalność administracyjną i uzupełniającą stany poprzez podległe Wojewódzkie Sztaby Wojskowe i podległe im wojskowe komendy uzupełnień.
Jednym z głównych zadań POW była odpowiedzialność za system obronny państwa. Zadanie to wykonywała poprzez dowodzenie jednostkami obrony terytorialnej.
Jednostki podległe dowódcy POW 1946 12 Dywizja Piechoty – Szczecin 16 Kaszubska Dywizja Piechoty – Gdańsk 1 Dywizja Kawalerii – Koszalin 16 Dnowsko-Łużycka Brygada Pancerna 13 Brygada Artylerii Ciężkiej 76 pułk artylerii 88 Pułk Artylerii Przeciwlotniczej 2 Batalion Łączności Okręgu Wojskowego – Bydgoszcz.