Markus Happe (ur. 11 lutego 1972 w Münsterze) – niemiecki piłkarz występujący na pozycji pomocnika.
Kariera klubowa Happe jako junior grał w klubie VfL Wolbeck. W 1990 roku trafił do Preußen Münster, grającego w 2. Bundeslidze. W 1991 roku spadł z nim z ligi. Wówczas odszedł do pierwszoligowego Bayeru 04 Leverkusen. W Bundeslidze zadebiutował 26 października 1991 w wygranym 1:0 meczu z Eintrachtem Frankfurt. 9 listopada 1991 w zremisowanym 2:2 spotkaniu z Bayernem Monachium zdobył pierwszą bramkę w trakcie gry w Bundeslidze. W 1993 roku zdobył z klubem Puchar Niemiec. W 1997 oraz 1999 wywalczył z Bayerem wicemistrzostwo Niemiec.
W grudniu 1999 roku podpisał kontrakt z innym pierwszoligowym zespołem, FC Schalke 04. Pierwszy ligowy mecz zaliczył tam 11 grudnia 1999 przeciwko TSV 1860 Monachium (3:3). W 2001 roku Happe zdobył z Schalke Puchar Niemiec oraz wywalczył z nim wicemistrzostwo Niemiec. Z klubem wystąpił także w finale Pucharu Ligi Niemieckiej, ale Schalke przegrało tam 1:4 z Herthą Berlin.