W Premier League Irlandczyk zadebiutował 1 października w meczu z West Ham UnitedGames played by Daryl Murphy in 2005/2006 , Soccerbase. 24 listopada został wypożyczony do Sheffield Wednesday. Przez jeden miesiąc w zespole tym wystąpił czterokrotnie. Następnie powrócił do Sunderlandu. 12 lutego 2006 roku w meczu ligowym z Tottenhamem Hotspur (1:1) Murphy strzelił swoją pierwszą bramkę dla „Czarnych Kotów”. Łącznie w sezonie 2005/2006 zagrał w 18 ligowych meczach (w tym 5 od pierwszej minuty) oraz zdobył jednego gola , Soccerbase. Sunderland zajął ostatnie miejsce w tabeli Premier League i spadł do Championship , Soccerbase. Klub Murphy’ego od razu wrócił do Premier League zajmując pierwsze miejsce w lidze , RSSSSF. Irlandczyk zagrał w 38 meczach i zdobył 10 goli. W następnych sezonach dalej był podstawowym zawodnikiem Sunderlandu. 17 lipca 2010 podpisał trzyletni kontrakt z Celtikiem. Kwota transferu wyniosła około 1,5 miliona funtów. 24 sierpnia 2011 został wypożyczony do Ipswich Town. 7 czerwca 2013 przeszedł do Ipswich Town definitywnie.