W sezonie 2007/2008 odniósł w niej dziewięć zwycięstw (najbardziej okazałe – 4:1 – z KSZO Ostrowiec Św. i Avią Świdnik), osiem pojedynków zremisował, a 15 przegrał (m.in. 0:5 z Górnikiem Wieliczka). W tabeli zajął 13. pozycję, a w wyniku reformy rozgrywek, w sezonie 2008/2009 znalazł się w III lidze, stanowiącej czwarty poziom ligowy. Ponadto w 2008 roku Naprzód wywalczył Puchar Polski na szczeblu okręgu – w dwumeczu finałowym okazał się lepszy od KSZO Ostrowiec Świętokrzyski (4:0, 1:4).

W sezonie 2009/2010 klub uplasował się na jednym z sześciu miejsc spadkowych, jednak Komisja do Spraw Nagłych Polskiego Związku Piłki Nożnej przyjęła wniosek Świętokrzyskiego i Małopolskiego Związku Piłki Nożnej o pozostawienie w sezonie 2010/2011 osiemnastu zespołów, co spowodowało, że degradacji uniknęły Naprzód i Górnik Wieliczka. W sezonie 2011/2012 jędrzejowska drużyna przegrała 21 z 30 meczów i zajmując ostatnie miejsce w tabeli spadła do IV ligi świętokrzyskiej.

Osiągnięcia III liga (ob. II liga): 13.