Poza walkami między sobą gracze maja także możliwość walki z wieloma różnorodnymi bossami. Po ostatnich zmianach bossy stały się silniejsze i wiele stanowi teraz spore wyzwanie nawet dla drużyny doświadczonych graczy. Na takich bossach można zdobyć wiele interesujących przedmiotów oraz dużą liczbę punktów doświadczenia.
Do gry zostały dodane instancje. Są to miejsca, w których drużyna ma określony czas na przejście przez nie i pokonanie wszystkich potworów znajdujących się w niej. Jest to element rozgrywki przeznaczony dla bardziej zaawansowanych graczy z dobrym ekwipunkiem, ponieważ w instancjach trzeba pokonać nawet kilku silnych bossów naraz. Jak na razie istnieją trzy instancje: Sealed Shrine Endless Tower Orc Dungeon
Serwery W Ragnaroka można grać na serwerach oficjalnych, takich jak iRO (International Ragnarok Online), euRO (European Ragnarok Online), kRO (Korean Ragnarok Online), cRO (Chinese Ragnarok Online) i wielu innych – praktycznie każdy azjatycki kraj ma swój własny serwer – a także, jak w przypadku wielu gier MMORPG, w Ragnaroka można grać za darmo na nieoficjalnych prywatnych serwerach, jednakże modyfikacja klienta (która jest wymagana do połączenia) jest nielegalna, serwery te mogą się różnić questami, postaciami odgrywanymi przez komputer, (NPC), ratem (szybkością zdobywania doświadzczenia) itd.