Przełom nastąpił 8 października 1988 roku, kiedy w szpitalu Saint-Louis w Paryżu przeprowadzono pierwsze na świecie udane przeszczepienie krwi pępowinowej. Dawczynią była nowo narodzona siostra pięcioletniego chłopca chorego na niedokrwistość Fanconiego, a zabieg wykonał zespół pod kierownictwem dr Eliane Gluckman. Transplantacja zakończyła się sukcesem i potwierdziła, że krew pępowinowa może być bezpiecznym i skutecznym źródłem komórek macierzystych.
Od tego czasu technologia ta zaczęła się dynamicznie rozwijać. Współcześnie krew pępowinowa jest uznanym źródłem materiału do terapii w ponad 80 chorobach hematologicznych, onkologicznych i metabolicznych, a jednocześnie stanowi przedmiot intensywnych badań nad nowymi zastosowaniami w medycynie regeneracyjnej.
W Polsce dokonano obecnie kilkuset przeszczepień komórek pochodzących z krwi pępowinowej. Pierwszy zabieg odbył się w 1994 roku. Pacjentem był chłopiec z ostrą białaczką szpikową, któremu zdrowe komórki oddała siostra. Podobne przeszczepienie, również w przypadku tej samej choroby, miało miejsce w 2000 roku.