Po zjednoczeniu Niemiec mały|Günter Schabowski w 2007 roku Po zjednoczeniu Niemiec Schabowski wziął na siebie moralną odpowiedzialność za zbrodnie systemu komunistycznego na obywatelach Niemiec, w tym także za strzelanie do ludzi nielegalnie przekraczających granicę. Stał się bardzo krytyczny zarówno wobec działań rządu Niemieckiej Republiki Demokratycznej, jak i swoich własnych.
Od 1992 do 1995 r. pracował jako dziennikarz w tygodniku Heimat-Nachrichten (tłumaczenie: Wiadomości z Ojczyzny), który założył wraz ze współpracownikami w Rotenburg an der Fulda.
W latach 90. pracował jako doradca Unii Chrześcijańsko-Demokratycznej podczas wyborów, co spowodowało, że na scenie politycznej został okrzyknięty mianem Krętogłowego, ptaka zwanego ze swojej umiejętności obracania głowy o 180 stopni. Było to popularne przezwisko, które nadawano komunistom, którzy zaczęli propagować kapitalizm.
W styczniu 1995 wszczęto postępowanie karne przeciwko niemu, Egonowi Krenzowi (ostatniemu sekretarzowi SED) oraz Güntherowi Kleiberowi. Po procesie, w którym przyznał się do winy i potępił działania rządu Niemieckiej Republiki Demokratycznej, został skazany na 3 lata więzienia. W 2000 roku został ułaskawiony przez ówczesnego burmistrza Berlina Eberharda Diepgena.