JC31 1-6 Począwszy od roku 2001 produkcja Hondy VT 125 C została przeniesiona do Europy, do Hiszpańskiej fabryki koncernu Montesa. Egzemplarze te posiadają numer VIN rozpoczynający się od znaków "VTM" (Honda Motorcycle, Manufactured in Spain) oraz oznaczenie wersji "JC31". Dzięsiąty symbol numeru VIN zawiera cyfrę od 1 do 6, oznaczającą rok produkcji motocykla: "1" - 2001, "6" - 2006. Podobnie jak w przypadku wersji JC29, jedenasty znak zawiera symbol kodowy fabryki: "E" - Montesa Honda S.A..
JC29A / JC29B W związku z obowiązującymi w Niemczech przepisami, ograniczającymi prędkość lekkich motocykli dla posiadaczy kategorii A1 do 80 km/h, Honda przygotowała na rynek niemiecki dodatkową wersję VT125C Shadow, spełniającą powyższy wymóg poprzez zastosowanie restrykcyjnego modułu zapłonowego typu N5BF. Ósmy symbol numeru VIN tych egzemplarzy motocykla stanowiła litera "B", zaś wersję motocykla określono symbolem JC29B. Równolegle sprzedawane były motocykle w wersji JC29A, pozbawione wyżej wymienionego ograniczenia.