1941–1944 Rejon ustrzycki przestał istnieć wraz z wybuchem wojny niemiecko-radzieckiej 22 czerwca 1941. Na mocy dekretu Adolfa Hitlera z 1 sierpnia 1941 obszar dawnej gminy Ustrzyki Dolne wszedł w skład Generalnego Gubernatorstwa i utworzonego tam nowego dystryktu Galicja, gdzie odtworzono gminę Ustrzyki Dolne w jej oryginalnych granicach. 15 listopada 1941 miasto i gminę Ustrzyki Dolne włączono do powiatu sanockiego w dystrykcie krakowskimDekret o zmianie granic Starostw Powiatowych i Związków Gmin w Okręgu Krakau, z dnia 3 listopada 1941 r. (Dziennik Rozporządzeń dla Generalnego Gubernatorstwa z dnia 30 listopada 1941 r., Krakau, Nr. 111, str. 659).
Podział gminy na gromady zachowano; zniesiono jedynie gromadę Bandrów Kolonia, włączając ją do gromady Bandrów Narodowy, a miasto Ustrzyki Dolne połączono z gminą wiejską, zachowując jednak status miasta. Liczba mieszkańców gminy w 1943 roku wynosiła 9998: 1032 w Bandrowie Narodowym, 1066 w Berehach Dolnych, 703 w Dźwiniaczu Dolnym, 683 w Hoszowczyku, 450 w Hoszowie, 443 w Jałowem, 650 w Jasieniu, 730 w Łodynie, 614 w Moczarach, 1100 w Równi, 408 w Strwiążyku i 2119 w Ustrzykach DolnychAmtliches Gemeinde- und Dorfverzeichnis fuer das GG.