Również w sezonie 2002/2003 Holenderka nie stanęła na podium żadnej międzynarodowej imprezy, jednak już w 2004 roku zwyciężyła na sprinterskich mistrzostwach świata w Nagano. Niecałe dwa miesiące później zdobyła srebrny medal na swym koronnym dystansie podczas dystansowych mistrzostw świata w Seulu, rozdzielając na podium Niemkę Anni Friesinger i Kanadyjkę Cindy Klassen. W biegu na 1000 m zajęła też trzecie miejsce na dystansowych mistrzostwach świata w Inzell w 2005 roku, gdzie na podium stanęły też jej rodaczka Barbara de Loor i Anni Friesinger. Ostatni medal zdobyła podczas igrzysk w Turynie w 2006 roku, gdzie zwyciężyła w biegu na 1000 m, wyprzedzając Chris Witty i Catrionę Le May Doan. Wielokrotnie stawała na podium zawodów Pucharu Świata, odnosząc przy tym trzynaście zwycięstw. W sezonie 2003/2004 zajęła drugie miejsce w klasyfikacjach końcowych 500 m i 1000 m, a sezon 2004/2005 ukończyła na trzeciej pozycji w klasyfikacji 1000 m.
Ustanowiła dwa rekordy świataSkater business card of Marianne Timmer .
W latach 2001–2003 jej mężem był amerykański panczenista i trener Peter Mueller. W 2012 roku wyszła za mąż za byłego piłkarza, Henka Timmera (zbieżność nazwisk przypadkowa).