Jedynym krajem, w którym znaleziono oba klady wirusa jest Kamerun.
Epidemiologia thumb|upright=1.5|Mapa odnotowanych zarażeń wirusem małpiej ospy. Ospę małpią po raz pierwszy zidentyfikowano u ludzi w 1970 roku w Demokratycznej Republice Konga u 9-letniego chłopca w regionie, w którym ospa prawdziwa została wyeliminowana w 1968 roku. Od tego czasu większość przypadków została zgłoszona na obszarze dorzecza Kongo. Kolejne przypadki coraz częściej zgłaszane były w Afryce Środkowej i Zachodniej.
Od 1970 r. odnotowano przypadki małpiej ospy u ludzi w 11 krajach afrykańskich – Beninie, Kamerunie, Republice Środkowoafrykańskiej, Demokratycznej Republice Konga, Gabonie, Wybrzeżu Kości Słoniowej, Liberii, Nigerii, Republice Konga, Sierra Leone i Sudanie Południowym. W latach 1996–1997 w Demokratycznej Republice Konga odnotowano epidemię z niskim współczynnikiem śmiertelności, lecz wyższym niż zwykle wskaźnikiem zakażeń. Od 2017 r. w Nigerii zanotowano ponad 500 podejrzeń zakażenia oraz ponad 200 potwierdzonych przypadków, a wskaźnik śmiertelności wynosi około 3%.